自考本科和函授本科的區別是學習形式不同、學制方面不同、考試方式不同以及文憑認可度不同。但自考本科和函授本科文憑與全日制享有同等效力，均可以通過中國高等教育學生信息網查詢學歷。

1.學習形式不同

函授的學習是以自學為主，院校會安排時間組織集中面授;自考本科的話完全以考生自己學習為主。

2.學制方面不同

自考本科沒有學制方面的限制，只要考完報考專業的所有科目都合格通過即可申請畢業，即一年考完一年畢業，五年考完五年畢業，只要8年內考完就行，相關時間政策根據當年政策情況。

3.考試方式不同

在入學時，自考本科沒有入學考試，報名自考本科的考生可以在每年的4月、10月參加單科考試，等到所有科目考試成績都合格后，可申請自考本科畢業，頒發學歷證書。

函授本科其實就是成人教育本科。成人教育學習形式分三個類別：脫產，業余，函授。現在一般所說的函授本科指的是成教本科。成教本科嚴進寬出，學生只有通過國家統一的成人高考考試，才能入學就讀。

報考函授本科的考生在10月考完后，第二年3月左右注冊學籍，兩年半畢業，在這兩年半期間會有周末或假期集中授課，屬于函授。入學后，每學期參加期末考試，學制為2.5年。

4.文憑認可度不同

從學歷文憑認可度來說，普通高等教育五大學歷教育是國家教育部最為正規且用人單位最為認可的學歷教育。因自考本科學歷獲取難度更大，所以自考本科的含金量要大于成人高考。